一般纳税人公司注销是必须要进行查账的，由税务局进行（看情况可能上门查账，也可能要求企业将账簿拿到税务进行)，属于必要程序。需要一般纳税人公司注销前，办理注销清算、结清发票并结清税款后注销税务登记。所以一般纳税人公司注销，查账是税务局肯定会进行的工作；一般来说税务局会根据一般纳税人公司注销的会计凭证、账簿、报表以及其它会计相关资料对企业经济业务的合法性合理性、会计核算的正确性以及财务会计制度等方面逐一检查。通过查账，税务局能够了解一般纳税人公司注销前，是否对各类会计核算资料真实且正确；而如果查账过程中出现问题，一般纳税人公司注销流程也会被停止，只有当税务问题处理完华后才可以继续申请，如果不是很大的问题往往补税交带纳金即可解决，而如果问题比较严重，还是建议选择与公司注销代理机构联系了解大概情况后再行交检，能够提前处理的尽量提前处理。