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古生物学家奥塞内尔·查利斯·马什(OthnielCharlesMarsh)根据发现的部分化石建立了迷惑龙属(Apatosaurus),属名来自希腊语中的“ἀπάτη”(意为“骗人、欺骗”)和“σαῦρος”(意为“蜥蜴”),合起来是“骗人的蜥蜴”,因为迷惑龙化石中的人字形骨与其他恐龙不同,反而与的海生爬行动物沧龙相似。迷惑龙的模式种名为埃阿斯迷惑龙(A.ajax), 种名来自希腊神话中的英雄大埃阿斯。
1903年,古生物学家埃尔默·里格斯(Elmer S.Riggs)指出,雷龙与迷惑龙非常类似,应为同种动物。按照国际动物命名委员会的规定,早建立的迷惑龙属具有命名优先权,雷龙变成无效名,被归入迷惑龙属,
名为秀丽迷惑龙(A.excelsus)。由于雷龙这个名字相当霸气和受欢迎,大众继续使用这个名字,雷龙也成为迷惑龙的非正式名称。1989年,美国邮政管理局发行了一套恐龙邮票,其中就包括雷龙。当时许多学者指出,雷龙是无效名,美国邮政管理局解释道,科学家使用迷惑龙这个名称,大众更熟悉雷龙。