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古生物学家奥塞内尔·查利斯·马什（OthnielCharlesMarsh）根据发现的部分化石建立了迷惑龙属（Apatosaurus），属名来自希腊语中的“ἀπάτη”（意为“骗人、欺骗”）和“σαῦρος”（意为“蜥蜴”），合起来是“骗人的蜥蜴”，因为迷惑龙化石中的人字形骨与其他恐龙不同，反而与的海生爬行动物沧龙相似。迷惑龙的模式种名为埃阿斯迷惑龙（A.ajax）， 种名来自希腊神话中的英雄大埃阿斯。
1903年，古生物学家埃尔默·里格斯（Elmer S.Riggs）指出，雷龙与迷惑龙非常类似，应为同种动物。按照国际动物命名委员会的规定，早建立的迷惑龙属具有命名优先权，雷龙变成无效名，被归入迷惑龙属，
名为秀丽迷惑龙（A.excelsus）。由于雷龙这个名字相当霸气和受欢迎，大众继续使用这个名字，雷龙也成为迷惑龙的非正式名称。1989年，美国邮政管理局发行了一套恐龙邮票，其中就包括雷龙。当时许多学者指出，雷龙是无效名，美国邮政管理局解释道，科学家使用迷惑龙这个名称，大众更熟悉雷龙。